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摘要:
目的采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)检测我国广东、福建地区2000~2001年手足口病(HFMD)散发病例中的肠道病毒71型(EV71),进而通过扩增VP1节段的核苷酸序列,进行毒株的种系进化分析. 方法以肠道病毒特异引物对EV-1、EV-2进行RT-PCR,经琼脂糖凝胶电泳鉴定为阳性的标本,进一步用EV71特异引物对159S、162A进行RT-PCR,扩增的VP1节段经纯化后与测序载体pGEM-T连接,转化大肠埃希菌DH5α,筛选后测序.所得序列与我国深圳、上海、武汉地区的EV71流行株,中国台湾1998年4例HFMD暴发分离的EV71毒株,及来自美国、日本、匈牙利等国家地区的EV71毒株的核苷酸序列,用ClustalX 1.8和PHYLIP 3.5进行比对分析,构建种系进化树. 结果 25份标本检测EV71的阳性率为20%,所得序列经种系进化分析,与肠道病毒71型的其他毒株同源,与深圳1998年HFMD散发分离的EV71毒株同源性为94%,与上海2000年HFMD暴发分离株同源性为94%~96%, 与武汉1987年HFMD病例中分离的毒株同源性为91%,而与国外EV71毒株同源性仅为82%~84%. 结论 EV71是我国南方地区HFMD的主要病原之一;我国大陆地区的EV71毒株在种系进化上有较高的同源性;与我国台湾地区大部分分离株亦有90%~91%的核苷酸同源性,但大陆EV71引起的HFMD发病症状较轻,有别于1998年台湾地区EV71的大暴发.
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文献信息
篇名 我国广东、福建地区2000~2001年手足口病肠道病毒71型分离株的种系进化分析
来源期刊 中华实验和临床病毒学杂志 学科 医学
关键词 手足口病 肠道病毒属 逆转录聚合酶链反应 种系发生
年,卷(期) 2004,(3) 所属期刊栏目 论著
研究方向 页码范围 227-229
页数 3页 分类号 R1
字数 2001字 语种 中文
DOI 10.3760/cma.j.issn.1003-9279.2004.03.008
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 谢健萍 1 117 1.0 1.0
2 何家鑫 2 289 2.0 2.0
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手足口病
肠道病毒属
逆转录聚合酶链反应
种系发生
研究起点
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期刊影响力
中华实验和临床病毒学杂志
双月刊
1003-9279
11-2866/R
大16开
北京市西城区迎新街100号126室
18-224
1987
chi
出版文献量(篇)
3761
总下载数(次)
8
总被引数(次)
19683
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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