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水杉核糖体蛋白基因MG-RPS6的生物信息学分析
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摘要：
水杉(Metasequoia glyptostroboides)是中国著名的杉科孑遗植物.近些年来,对水杉的生态习性、病虫害防治和生物活性的研究已经取得了一定的成果,但是在分子水平的相关研究还很少.本研究以水杉原生种为植物材料,从三代测序的全长转录组文库中克隆了一个核糖体蛋白基因(MG-RPS6).对MG-RPS6基因进行生物信息学分析,结果显示:该基因的全长cDNA为1 365 bp,分子量为423.20 kD,编码氨基酸数量为251个,编码蛋白为核糖体蛋白S6;该蛋白的分子量为28 609.46 kD,等电点为10.76,总平均吸水值为-0.847,不稳定指数为47.21;该蛋白含有20个常见功能位点,有28个磷酸化位点,含有典型的核糖体蛋白S6e结构域;二级结构包括8个折叠区、3个螺旋区和一些无规则卷曲区;三级结构分析结果进一步证实本研究克隆的基因为真核生物核糖体蛋白S6基因;通过构建系统进化树,证实水杉和日本柳杉具有较近的亲缘关系.本实验结果可以为水杉及其它物种的核糖体蛋白基因的结构和功能研究提供参考.
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水杉(Metasequoia glyptostroboides)
基因
核糖体蛋白
生物信息学分析
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期刊影响力
分子植物育种
主办单位：
海南省生物工程协会
出版周期：
半月刊
ISSN：
1672-416X
CN：
46-1068/S
开本：
大16开
出版地：
海南省海口市海秀大道128号双岛公寓13B室
邮发代号：
84-23
创刊时间：
2003
语种：
chi
出版文献量（篇）
7272
总下载数（次）
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